贵阳公积金冲抵商贷本金的流程如下：首先，借款人需要到贵阳市公积金管理中心办理公积金冲抵商贷的手续。

然后，借款人需提供相关材料，包括公积金账户信息、商贷合同等。

接下来，贵阳市公积金管理中心会核实借款人的资格和申请材料，并进行审核。一旦审核通过，公积金中心会将冲抵金额直接转入借款人的商贷账户，用于抵扣商贷本金。

最后，借款人需按时按月还款，同时公积金冲抵商贷的本金将逐渐减少，直到商贷还清。