在京东金融的省呗应用中，全部结清的步骤如下：

用户进入省呗应用，找到相关的还款选项。

按照提示选择全部的期数。

确认还款金额无误后，进行还款操作，完成全部结清的过程。

需要注意的是，省呗是一次性收取手续费的，所以即使用户选择提前还款，之前缴纳的手续费也不会退还。此外，省呗提供了自动还款和手动还款两种方式，用户可以根据自己的需求选择合适的还款方式。

以上信息仅供参考，如有需要，建议咨询省呗客服。