在南京市建邺区。根据查询南京市人民政府官网显示，南京儿童医院河西属于南京市建邺区，南京市儿童医院，亦名南京医科大学附属儿童医院、江苏省红十字儿童医院是一所集医疗、科研、教学、康复、保健为一体的三级甲等儿童医院。