新农合是由政府推行的一项基本医疗保障制度，旨在为农村居民提供医疗保障。在不同的市区，可能会有不同的管理机构对新农合进行管理，因此在不同区域是否可以使用新农合要以当地政府政策规定为准。

一般情况下，跨区使用新农合需要在原籍地注销后重新登记，同时了解目标地的相关政策，以便在新的市区使用新农合。总的来说，要根据当地政策规定来确定是否可以在不同区域使用新农合。