免疫系统不知道眼睛的存在。免疫系统是人体的一种防御机制，它通过一系列的免疫反应来保护身体免受疾病和感染的侵害。而眼睛只是人体的一部分，它并没有直接参与到免疫系统的反应中。因此，免疫系统并不知道眼睛的存在。