长安汽车总部位于重庆市南岸区，主要原因是受到政策支持和地理位置的优势。

政策支持：重庆市政府一直致力于吸引外资和鼓励发展汽车产业，出台了一系列优惠政策，并提供了完善的基础设施和服务保障。

地理位置优势：重庆是连接东、南、西三大经济区的交通枢纽城市，地理位置优越，交通运输便捷，方便长安汽车的物流和销售。

此外，重庆市区交通繁忙，城市规模适中，劳动力市场较为稳定，也是长安汽车选择在这里设立总部的因素之一。