可以办理因为虽然申根签证和日本签证是不同国家的签证，但是拥有申根签证可以表明持有者具有良好的出境记录和身份，这对于申请其他国家的签证会有一定的积极影响。

不过需要注意的是，具体办理流程和要求可能会根据个人情况和使馆规定有所不同。

在申请日本签证前应该确保自己符合签证的各项要求，并根据要求准备好所需材料，如有效的护照、签证申请表、行程计划等等。

同时，还需注意申请时间和地点，避免因时间紧迫或办理地点不当造成无法顺利办理签证的情况。