C1驾驶证扣6分，**可以在本记分周期内缴纳罚款并清除记分，也可以等到下一个记分周期再处理**。

根据现行的交通管理规定，C1驾驶证的记分周期为12个月，从驾驶证初次领取之日起计算。在一个记分周期内，如果驾驶证累积扣分未满12分，那么在周期结束时，**这些分数会被清零**。如果在周期结束前没有及时处理违章和缴纳罚款，那么这些分数会被转入下一个记分周期。

因此，如果你的C1驾驶证扣了6分，你可以选择在本记分周期内处理违章并缴纳罚款，以避免分数转入下一个周期。同时，你也可以选择在**记分周期结束后，新的周期开始时再处理这些违章**，这样做的好处是可以避免在当前周期内因累计分数过高而面临更严重的处罚。

需要注意的是，如果驾驶证处于实习期，那么在实习期内累积扣分达到12分，将会被注销实习期的准驾车型资格。因此，对于实习期的驾驶人来说，应该更加注意遵守交通规则，避免违章扣分。