农村医保在深圳住院的报销比例和金额是根据具体的政策和标准来确定的，具体情况可能会有所不同。一般来说，农村医保在深圳的住院报销比例较高，可以报销一部分的医疗费用。在一些特殊情况下，如患有罕见病、困难群体、特困人员等，报销比例和金额可能会更高。具体的报销比例和金额可以咨询当地的医保部门或参考相关政策文件。