特殊门诊在医院住院的费用是否可以得到报销，主要取决于具体的医保政策以及患者的病种和治疗情况。

通常情况下，特殊门诊的设立是为了满足一些不需要住院但可以在门诊进行治疗的大病和慢性病患者的需求。这些特殊门诊可以帮助癌症患者在术后稳定期进行门诊治疗，从而减轻医疗费用。对于这类在特殊门诊进行的治疗，医保政策可能会有相应的报销规定。

然而，当涉及到住院的情况时，报销的规定可能会有所不同。对于特殊门诊患者住院的情况，首先需要确定该病种是否属于医保的报销范围，以及是否符合住院的医学必要性。如果满足这些条件，那么住院费用中的一部分可能会得到医保的报销。

但具体的报销比例、起付标准以及报销范围等，都会因地区、医保政策以及具体的病种和治疗情况而有所不同。因此，建议患者在住院前向所在医院的医保部门或当地的社保机构进行详细咨询，了解具体的报销政策和流程。

总的来说，特殊门诊在医院住院的费用是否可以得到报销，需要根据具体的医保政策和患者的治疗情况来确定。患者在住院前最好咨询相关部门，以获取准确的信息。