据分析，山羊3被鲸鱼吃掉的地理位置可能在海洋中深处，或者在近海的海底附近。这是因为鲸鱼主要在海洋中捕食，而山羊3可能是在海岸边附近跑到了水中，遭遇了不幸。另外，考虑到山羊3被吃掉之后动物尸体通常会沉入海底，所以其具体地理位置难以确定。因此，只能根据可能发生的情况来推测其被鲸鱼捕食的位置。