T2为新航站楼。其中A岛为南航专属值机区域，D岛为国际航班（含港澳台航班）旅客专属值机区域。出发层有1号、2号、3号、4号共4个大门，分别对应候机楼大厅里的A、B、C、D共4组椭圆形岛式办票柜台。

其中A岛为南航专属值机区域，南航所有非国际航班旅客均在A岛区域办理值机手续、行李交运、自助值机、问询等业务。

D岛为国际航班（含港澳台航班）旅客专属值机区域，出境、出国旅客均在D岛区域办理相关手续。

B岛、C岛则为除南航和国际航班旅客外其它所有乘客办理相关手续。整个T2航站楼共布设座位6390余个。