海尔智能马桶盖C6与E6最明显的区别在于C6采用电力加热器加热座圈，而E6则采用了水循环加热方式。此外，E6具有静音降温功能，可以在使用后自动开启降温模式，而C6则未加入此功能。

另外，E6配备了独特的离子发生器与活性炭滤网，可以有效去除空气中的异味和细菌。总体而言，E6的功能更加全面，而C6则相对简洁实用，用户可以根据自己的需求选择适合的产品。