Sony S40R音响系统的HDMI和光纤接口在传输音频信号方面存在显著差异。

HDMI接口，全称“高清晰度多媒体接口”，是一种全数字化视频和声音传输接口，可以同时传输音频和视频信号，且传输质量较高。它广泛应用于电视、投影仪、音响等设备，是现代家庭娱乐设备中不可或缺的接口类型。使用HDMI接口，可以享受到高质量的影音体验，对于家庭影院系统来说是非常重要的。

光纤接口则是一种常见的音频传输方式，它通过光信号传输音频数据，具有传输速度快、信号稳定的特点。光纤接口常用于连接CD播放器、DVD播放器等音源设备和音响系统，以实现高品质的音乐播放。

总的来说，HDMI和光纤在音频传输方面各有特点，选择哪种接口主要取决于具体的设备和应用场景。在构建家庭影院或追求高质量影音体验时，HDMI接口可能是更好的选择；而在需要稳定传输高质量音乐时，光纤接口则更具优势。