南京到西双版纳的最佳路线是从南京禄口机场乘坐飞机到昆明，再转机到西双版纳嘎洒机场。该路线最为方便快捷，航班多且时间灵活。此外，还可选择从南京坐高铁到昆明，然后转机或乘巴士到西双版纳。虽然这种方式时间较长，但沿途可欣赏到绝美的中国南方风景。无论哪种方式，建议提前做好行程规划和酒店预订，以避免出现意外情况。