主要是由于历史和地理原因。

首先，曲阜和兖州两地距离较近，仅相隔约 100 公里。建站时，考虑到方便两地居民出行和促进地区交流，将火车站设在兖州更为合理。其次，兖州地区地势较为平坦，交通便利，有利于铁路线路的建设和维护。而曲阜则主要以山地为主，地势较为复杂，建站成本较高。

另外，历史上兖州曾是鲁国国都，有着丰富的历史文化底蕴，而曲阜则是孔子的故乡，同样具有极高的文化价值。将火车站设在兖州，也有助于推动当地旅游业的发展。