马腰以前是乡，后来是镇，而现在只是村的建制。

而据清康熙朝高必腾《乌程县志》载：邑东有南浔、乌镇、马要、淤溪诸大镇。可见马腰在古代是与南浔齐名的重镇。另据周庆云《南浔志》里记载，元代至明代初年，南浔镇归属马腰后潘村巡检司管辖。至今南浔人口中津津乐道的“九里三阁老，十里两尚书”中所展示的五位高官中，就有两位其实是马腰人，而且是亲哥俩。

南林这个地名也大有来头。南宋淳祐末年，南浔镇由两个村落合并而成，处在南栅的叫南林村，北栅的叫浔溪村 。南林村中有南林寺，据说初创于五代吴越国显德年间，寺址位于后来的报国寺附近。

不知从何时起，南林村移置于马腰镇辖下的一个行政村，包括斜桥兜、御史兜、西林村、烧箕兜、莫家湾、升罗兜、杨安兜等自然村。