在支付宝上进行异地就医备案时，备案的结束时间可以按照以下步骤进行选择：

开始日期：应填写为住院前1-2日。例如，如果住院日为3月8日，那么开始日期应填写为3月7日。

结束日期：应填写为预计出院日后的五或十天。例如，如果住院日为3月8日，预计住院十天，那么结束日期应填写为3月23-28日之内。也可以根据个人需求来选择结束日期，例如仅需使用自助开通功能进行本次就医，那么结束日期可以填写您就医完成后的日期；如果希望长期使用该功能，那么结束日期可以填写一个较长的时间范围，例如一年或更长时间。

请注意，开始日期应早于住院时间，结束时间应该晚于住院时间。此外，异地就医备案的开通期限一般为一个月，可以根据需要进行续开。填写完毕后，就完成了异地就医备案的结束时间选择。