新生儿耳朵畸形的医疗责任赔偿标准根据该地区有关规定和医院制定的内部规范来定。一般来说，可以按照病人的医疗费用、康复治疗费用及其产生的损失等因素，对病人给予赔偿，有时还需要支付心理赔偿金。