局部有充填和可见有机物是两个不同的概念，它们在含义和应用上有明显的区别。

局部有充填通常指的是在某个区域或部位中，存在某种物质或材料来填补或占据原有的空间或缺陷。在地质学或材料科学中，充填通常指的是用某种物质（如矿物质、合成材料等）来填补岩石或材料的空隙或裂缝。这种充填可以是天然的，也可以是人为的。例如，在宝石学中，一些宝石可能经过优化处理，如注胶或微沁，以改善其外观或增加其重量。这些处理过程中，可能会使用某些物质来充填宝石内部的空隙或裂缝，使其看起来更加完美。

而可见有机物则指的是在某个区域或部位中，存在可以被观察到的有机物质。有机物是由碳、氢、氧、氮等元素组成的化合物，它们通常具有生命活性或曾经是生命体的一部分。在地质学或材料科学中，可见有机物可能指的是化石、植物残骸、动物遗骸等。在宝石学中，一些宝石可能含有可见的有机物包裹体，这些包裹体可以是有机质或生物残骸，它们被包裹在宝石内部并形成了独特的纹理或图案。

因此，局部有充填和可见有机物的主要区别在于它们所描述的物质和现象不同。局部有充填主要关注的是填补空隙或裂缝的物质或材料，而可见有机物则主要关注的是具有生命活性或曾经是生命体一部分的有机物质。在宝石学领域中，这两者都可能存在，并且对于评估宝石的品质和价值具有重要意义。