济宁货车营运证申请电子版需要按照以下步骤操作：

1. 登录“运政帮”微信小程序，进入“我的”页面，选择“登录/注册”，点击“注册”，输入手机号和验证码，完成注册。

2. 在“我的”页面，点击“绑定车辆”，根据提示输入车辆号牌、车辆颜色、道路运输证号等信息，查询并绑定车辆。

3. 在主页面中，点击“营运车辆电子证照”，进入电子证照页面。

4. 在电子证照页面中，点击“上传照片”，上传车辆照片。

5. 上传照片后，点击“提交”，等待交通审批人员审核。

6. 如果审核通过，制发电子证照，可以在电子证照页面查看和下载。

需要注意的是，在申请电子版货车营运证时，需要确保所提交的信息真实准确，并且符合济宁市的相关规定。如果有任何疑问或问题，可以咨询当地交通管理部门或相关机构。