边境牧羊犬刚出生时比较小，毛色不太明显，眼睛和耳朵都是闭着的。通常在出生后两周左右，它们的眼睛和耳朵才会慢慢打开。刚出生时，它们身上的毛很少，颜色也比较淡，一般为白色、奶油色或灰色。

随着时间的推移和生长发育，它们的毛色会逐渐变为黑色、棕色、蓝色或杂色，但透过毛色的变化，可以看出它们的基本遗传特征。

虽然它们刚出生的时候比较脆弱和需要照顾，但经过几周的生长和发育，它们就会变得更加健康和活泼。