红树林在凌晨是否可以进去，要看具体情况而定。一般来说，红树林是一个保护生态环境的自然保护区，为了保护区内的动植物和生态环境，通常不允许在夜间进入。此外，红树林也存在着一定的安全隐患，比如蚊虫叮咬、蛇虫出没等，凌晨进入更容易遇到这些问题。

因此，如果没有相关部门的特别许可，一般情况下不建议在凌晨进入红树林，以免对自身安全和环境造成损害。