错层自建房地基并不一定都是一样高的，这取决于设计和地形条件。如果设计师在规划时考虑到了地形的变化，将地块分段进行方案设计，使得地基高度可以因地制宜，确保整个建筑的稳定性和安全性。

而如果没有考虑到地形条件，地基高度就可能会不一致，这样可能会导致建筑物不平衡或者不稳定，在长期使用中出现隐患。因此，在错层自建房中，要结合实际情况灵活处理，确保建筑物的稳定和安全。