跨省注册分公司流程如下：提交名称预先核准申请、领取名称预先核准通知书、提交设立分公司申请材料、领取营业执照。

所需材料包括：注册申请书、股东会决议或独资企业投资人出资证明、法定代表人任职证明、住所使用证明、章程、股东或出资人身份证明。

材料经核验无误后，工商局发放营业执照。