当然可以。仲裁金额的大小并不影响公司是否有权起诉。当劳动争议经过仲裁后，如果公司对仲裁结果不满，它完全有权利在规定的时间内向人民法院提起诉讼。

这里的“规定时间”一般是指自收到仲裁裁决书之日起的十五日之内。因此，即使仲裁金额不超过3万，公司仍然有权根据法律程序向法院提起诉讼。但请注意，起诉必须符合法律所规定的条件，例如需要有明确的被告、具体的诉讼请求和事实理由，以及案件必须属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院的管辖等。

在起诉时，公司还需准备相关的起诉材料，如起诉状和证据等。