剔除港股通指数是指在计算国内股市的综合指数时，将港股通市场中的股票剔除出去，以保持指数计算的相对稳定性和准确性。港股通指的是香港联交所上市的港股，由于香港市场与内地市场不同，市场波动和变化较大，所以在国内股市的综合指数中剔除港股通的股票可以更好地反映国内股市的整体走势和发展状况。