个人提取公积金不会直接影响银行代扣业务。但是，如果提取公积金后导致工资账户余额不足，可能影响代扣业务的正常进行，因为银行需要在账户余额足够的情况下才能代扣成功。

此外，如果长期频繁提取公积金，可能会影响个人信用评分，从而影响银行代扣业务的信用评估结果。